Моя проблема "вирішилась" переходом на Gnome desktop, під час якого автоматично встановився якийсь фоновий демон що запускає рантайм GTK і його залежності оперативній пам'яті. Якщо хтось знає, як він називається - то поділіться, але думаю, що причина саме в тому, що i3 взагалі ніяк не організовує робочий стіл і запускає сервер для GTK програм при кожному їх запуску, навіть якщо то звичайний калькулятор. Тому до лампочки така економія ОЗП якщо це не якийсь упоротий одноплатник а повноцінний робочий стіл.