Здається, помилка вказує на те, що конфігураційний скрипт gpg-error-config не знаходиться у вашій системі. Це може бути пов'язано з тим, що вам потрібно встановити пакет libgpg-error-dev або аналогічний для вашої системи.

Спробуйте встановити цей пакет за допомогою вашого менеджера пакетів. Для Debian це може бути apt:

sudo apt update
sudo apt install libgpg-error-dev

Після встановлення цього пакету спробуйте знову скомпілювати Deja-Dup, і це, мабуть, вирішить проблему з gpg-error-config.